fruitberryПлодоводство и ягодоводство РоссииPomiculture and small fruits culture in Russia2073-4948ФГБНУ ВСТИСП10.31676/2073-4948-2024-79-7-15fruitberry-1306Research ArticleГЕНЕТИКА, СЕЛЕКЦИЯ, СЕМЕНОВОДСТВОGENETICS, BREEDING, SEED PRODUCTIONИзучение генетического полиморфизма перспективных сортов малины методом SSR-маркированияGenetic polymorphism of promising raspberry varieties determined by SSR genotypinghttps://orcid.org/0000-0003-3629-4461КапитоваИ. А.KapitovaI. A.

снс, канд. хим. наук

Москва

Moscow

https://orcid.org/0009-0008-9412-4579ТарасоваЕ. В.TarasovaE. V.

мнс

Москва

Moscow

lisatarlen@gmail.comФедеральный научный селекционно-технологический центр садоводства и питомниководстваРоссияFederal Horticultural Center for Breeding, Agrotechnology and NurseryRussian Federation202402012025790715Copyright © Капитова И.А., Тарасова Е.В., 20252025Капитова И.А., Тарасова Е.В.Kapitova I.A., Tarasova E.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.plodovodstvo.com/jour/article/view/1306

   В статье приводятся результаты изучения генетического полиморфизма сортов и перспективного гибрида малины селекции ФГБНУ ФНЦ Садоводства (‘Пингвин’, ‘Скромница’, ‘Ариша’, ‘Комсомольская Правда’, ‘Иван Купала’, ‘Салют’, ‘Лавина’, ‘Юбилейная Куликова’, № 10-165-11). Для дифференциации изучаемых генотипов по степени генетического сходства был проведен SSR-анализ с использованием 15 локусов (RhM011, RiM019, RhM003, RiG001, Rubus123a, Rubus285a, Rubus270a, Rubus275а, RhM043, RhM021, RiM017, RiM015, RсFH01, RiAS01, RiMY01). По всем 15 локусам выявлены уникальные наборы полиморфных аллелей и составлены генетические профили для каждого сортообразца. Среднее количество полиморфных фрагментов ДНК на один локус составило 3,6. Наибольшее количество полиморфных ампликонов на локус достигало 6. На основе результатов генотипирования вычислены коэффициенты генетического сходства изучаемых сортообразцов. Составленная матрица коэффициентов была использована для проведения кластерного анализа. В результате кластеризации выделены группы образцов по степени генетического сходства. В самую многочисленную группу вошли сортообразцы: ‘Ариша’, ‘Комсомольская Правда’, ‘Салют’, ‘Юбилейная Куликова’, ‘Пингвин’, № 10-165-11. Наибольшие отличия по генетическим формулам в выборке сортообразцов были выявлены для сортов ‘Лавина’, ‘Скромница’ и ‘Иван Купала’. Полученные данные дополняют известные сведения о фенотипических особенностях сортов и в дальнейшем могут быть применены для эффективного составления схем скрещивания в селекции малины.

   In this research, we investigate the genetic polymorphism of raspberry varieties and a promising raspberry hybrid bred at the Federal Horticultural Center for Breeding, Agrotechnology, and Nursery. The research objects were the following varieties: Penguin, Skromnitsa, Arisha, Komsomolskaya Pravda, Ivan Kupala, Salut, Lavina, Yubileynaya Kulikova, and No. 10-165-11. To differentiate the studied genotypes by the degree of genetic similarity, an SSR marker analysis was performed using the following 15 loci: RhM011, RiM019, RhM003, RiG001, Rubus123a, Rubus285a, Rubus270a, Rubus275a, RhM043, RhM021, RiM017, RiM015, RcFH01, RiAS01, and RiMY01. Across all 15 loci, unique sets of polymorphic alleles were identifi ed, and genetic profi les for each specimen were compiled. The average number of polymorphic DNA fragments per locus was equal to 3.6. The highest number of polymorphic amplicons per locus reached 6. The results of genotyping were used to calculate the coeffi cients of genetic similarity of the studied varieties. The complied coeffi cient matrix was subsequently used for cluster analysis. As a result of clustering, groups of genetically similar varieties were identifi ed. The largest group included Arisha, Komsomolskaya Pravda, Salut, Yubileynaya Kulikova, Penguin, and No. 10-165-11. Lavina, Skromnitsa, and Ivan Kupala specimens showed the largest genetic variations. The data obtained elucidates the current understanding of the phenotypic features of raspberry varieties and can be used when developing eff ective crossing schemes in raspberry breeding.

генетический полиморфизмкластерный анализSSR-маркированиеRubus idaeus L.малинаgenetic polymorphismcluster analysisSSR markersRubus idaeus L.raspberryReferencesАллануров А., Беглеков Я., Рейимов С., Овезгелдиев Р. Генетическое разнообразие растений и его сохранение для обеспечения продовольственной безопасности, Всемирный ученый. 2024;23(1);191-199. ISSN 2712-083D.Аллануров А., Беглеков Я., Рейимов С., Овезгелдиев Р. Генетическое разнообразие растений и его сохранение для обеспечения продовольственной безопасности, Всемирный ученый. 2024;23(1);191-199. ISSN 2712-083D.Чесноков Ю. В., Косолапов В. М., Савченко И. В. Морфологические генетические маркеры растений, Генетика. 2020;12(56):1366-1377. DOI: 10.31857/S0016675820120048.Чесноков Ю. В., Косолапов В. М., Савченко И. В. Морфологические генетические маркеры растений, Генетика. 2020;12(56):1366-1377. DOI: 10.31857/S0016675820120048.Гашенко Т. А., Фролова Л. В., Божидай Т. Н. Изучение генетического разнообразия образцов малины с использованием SSR-маркеров, Плодоводство. 2023;35(2):54-61. DOI: 10.1234/0134-9759-2023-35-54-53.Гашенко Т. А., Фролова Л. В., Божидай Т. Н. Изучение генетического разнообразия образцов малины с использованием SSR-маркеров, Плодоводство. 2023;35(2):54-61. DOI: 10.1234/0134-9759-2023-35-54-53.Столповский Ю. А., Пискунов А. К., Свищева Г. Р. Геномная селекция. I. Последние тенденции и возможные пути развития, Генетика. 2020;56(9):1006-1017. DOI: 10.31857/S0016675820090143.Столповский Ю. А., Пискунов А. К., Свищева Г. Р. Геномная селекция. I. Последние тенденции и возможные пути развития, Генетика. 2020;56(9):1006-1017. DOI: 10.31857/S0016675820090143.Камнев А. М., Антонова О. Ю., Дунаева С. Е. Молекулярные маркеры в исследованиях генетического разнообразия представителей рода Rubus L. и их перспективы в селекции, Вавиловский журнал генетики и селекции. 2020;24(1):20-30. DOI: 10.18699/VJ20.591.Камнев А. М., Антонова О. Ю., Дунаева С. Е. Молекулярные маркеры в исследованиях генетического разнообразия представителей рода Rubus L. и их перспективы в селекции, Вавиловский журнал генетики и селекции. 2020;24(1):20-30. DOI: 10.18699/VJ20.591.Meng Q, Manghwar H, Hu W. Study on Supergenus Rubus L.: Edible, Medicinal, and Phylogenetic Characterization, Plants. 2022;11(9):1211. DOI: 10.3390/plants11091211.Meng Q, Manghwar H, Hu W. Study on Supergenus Rubus L.: Edible, Medicinal, and Phylogenetic Characterization, Plants. 2022;11(9):1211. DOI: 10.3390/plants11091211.Šiško M., Ivančič A., Šušek A. Determination of Raspberry Cultivar Authenticity Based on Multiplexed Microsatellite Fingerprinting, International Journal of Fruit Science. 2021;21(1):1018-1029. DOI: 10.1080/15538362.2021.1975011.Šiško M., Ivančič A., Šušek A. Determination of Raspberry Cultivar Authenticity Based on Multiplexed Microsatellite Fingerprinting, International Journal of Fruit Science. 2021;21(1):1018-1029. DOI: 10.1080/15538362.2021.1975011.Фролова Л. В., Гашенко Т. А., Гашенко О. А. Современные направления селекции малины, Плодоводство. 2021;33:211-226. DOI: 10.47612/0134-9759-2021-33-211-226.Фролова Л. В., Гашенко Т. А., Гашенко О. А. Современные направления селекции малины, Плодоводство. 2021;33:211-226. DOI: 10.47612/0134-9759-2021-33-211-226.Draper J., Armitage F., Dury G., Jacob L., Walden R., Kumar A., Jeff erson R., Hamil D. Plant genetic transformation and gene expression. A laboratory manual. Oxford; Boston: Black-well Scientifi c Publications, 1988, 366 p.Draper J., Armitage F., Dury G., Jacob L., Walden R., Kumar A., Jeff erson R., Hamil D. Plant genetic transformation and gene expression. A laboratory manual. Oxford; Boston: Black-well Scientifi c Publications, 1988, 366 p.Lebedev V. G., Subbotina N. M., Maluchenko O. P., Krutovsky K. V., Shestibratov K. A. Assessment of genetic diversity in diff erently colored raspberry cultivars using SSR markers located in flavonoid biosynthesis genes, Agronomy. 2019;9(9):518. DOI: 10.3390/agronomy9090518.Lebedev V. G., Subbotina N. M., Maluchenko O. P., Krutovsky K. V., Shestibratov K. A. Assessment of genetic diversity in diff erently colored raspberry cultivars using SSR markers located in flavonoid biosynthesis genes, Agronomy. 2019;9(9):518. DOI: 10.3390/agronomy9090518.Castillo N.F.R., Reed B. M., Graham J., Fernandez-Fernandez F., Bassil N. V. Microsatellite markers for raspberry and blackberry. J Am Soc Hortic Sci. 2010;135(3):271-278. DOI: 10.21273/JASHS.135.3.271.Castillo N.F.R., Reed B. M., Graham J., Fernandez-Fernandez F., Bassil N. V. Microsatellite markers for raspberry and blackberry. J Am Soc Hortic Sci. 2010;135(3):271-278. DOI: 10.21273/JASHS.135.3.271.Fernandez-Fernandez F., Antanaviciute L., Govan C. L., Sargent D. J. Development of a multiplexed microsatellite set for fingerprinting red raspberry (Rubus idaeus) germ-plasm and its transferability to other Rubus species. J Berry Res. 2011;1:177-187.Fernandez-Fernandez F., Antanaviciute L., Govan C. L., Sargent D. J. Development of a multiplexed microsatellite set for fingerprinting red raspberry (Rubus idaeus) germ-plasm and its transferability to other Rubus species. J Berry Res. 2011;1:177-187.Jaccard P. Distribution de la flore alpine dans le Bassin des Dranses et dans quelques regions voisines. Bull. Soc, Vaudoise sci. Natur. 1901;37:241-272.Jaccard P. Distribution de la flore alpine dans le Bassin des Dranses et dans quelques regions voisines. Bull. Soc, Vaudoise sci. Natur. 1901;37:241-272.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.