Для создания новых сортов плодовых культур важно эффективно использовать генетические ресурсы, исследуя их современными методами молекулярной биологии и генетики, что требует высококачественных образцов ДНК. Экстракция ДНК из растительного материала сложна из-за ингибирующих веществ, таких как полифенолы и полисахариды. В исследовании проведено сравнение четырех модификаций ЦТАБ-метода для экстракции ДНК из лиофилизированных листьев вишни обыкновенной (сорта ‘Ассоль’, ‘Белые Журавли’, ‘Русинка’) и черешни (сорта ‘Подарок Рязани’, ‘Фатеж’, ‘Чермашная’). Испытаны модификации с изменением состава лизирующего буфера и отмывочного раствора. Контрольный метод – оригинальный ЦТАБ. Экстракция проводилась в трехкратной повторности. Концентрация и чистота ДНК измерялись на спектрофотометре, деградация оценивалась с помощью электрофореза, а ингибиторы – с использованием ПЦР в реальном времени. В ходе проведенного исследования установлено, что первая модификация метода ЦТАБ обеспечивает получение образцов ДНК с наивысшей степенью чистоты. Анализ спектрофотометрического показателя А260/280 продемонстрировал значения в диапазоне от 1,89 до 1,91 со средним значением 1,87 для первой модификации. Вторая модификация также позволила получить высокоочищенные образцы ДНК, однако в некоторых было отмечено присутствие незначительного количества РНК. Показатель А260/230 подтвердил преимущество первой модификации ЦТАБ-метода в получении высокоочищенной ДНК. Среднее значение составило 2,08, что сопоставимо с показателем оригинального метода. Определение концентрации ДНК в водных растворах выявило наибольший выход ДНК при использовании первой модификации ЦТАБ-метода. Концентрация варьировалась от 594,80 до 852,10 мкг/мл со средним значением 700,82. Статистический анализ подтвердил достоверное превосходство первой модификации по сравнению с контролем (и другими модификациями) в отношении показателей чистоты и выхода ДНК. На основании полученных результатов первая модификация ЦТАБ-метода рекомендована как оптимальный вариант для экстракции ДНК из растительного материала вишни обыкновенной и черешни.