Изучение генетического полиморфизма перспективных сортов малины методом SSR-маркирования

   В статье приводятся результаты изучения генетического полиморфизма сортов и перспективного гибрида малины селекции ФГБНУ ФНЦ Садоводства (‘Пингвин’, ‘Скромница’, ‘Ариша’, ‘Комсомольская Правда’, ‘Иван Купала’, ‘Салют’, ‘Лавина’, ‘Юбилейная Куликова’, № 10-165-11). Для дифференциации изучаемых генотипов по степени генетического сходства был проведен SSR-анализ с использованием 15 локусов (RhM011, RiM019, RhM003, RiG001, Rubus123a, Rubus285a, Rubus270a, Rubus275а, RhM043, RhM021, RiM017, RiM015, RсFH01, RiAS01, RiMY01). По всем 15 локусам выявлены уникальные наборы полиморфных аллелей и составлены генетические профили для каждого сортообразца. Среднее количество полиморфных фрагментов ДНК на один локус составило 3,6. Наибольшее количество полиморфных ампликонов на локус достигало 6. На основе результатов генотипирования вычислены коэффициенты генетического сходства изучаемых сортообразцов. Составленная матрица коэффициентов была использована для проведения кластерного анализа. В результате кластеризации выделены группы образцов по степени генетического сходства. В самую многочисленную группу вошли сортообразцы: ‘Ариша’, ‘Комсомольская Правда’, ‘Салют’, ‘Юбилейная Куликова’, ‘Пингвин’, № 10-165-11. Наибольшие отличия по генетическим формулам в выборке сортообразцов были выявлены для сортов ‘Лавина’, ‘Скромница’ и ‘Иван Купала’. Полученные данные дополняют известные сведения о фенотипических особенностях сортов и в дальнейшем могут быть применены для эффективного составления схем скрещивания в селекции малины.

1. Аллануров А., Беглеков Я., Рейимов С., Овезгелдиев Р. Генетическое разнообразие растений и его сохранение для обеспечения продовольственной безопасности, Всемирный ученый. 2024;23(1);191-199. ISSN 2712-083D.

2. Чесноков Ю. В., Косолапов В. М., Савченко И. В. Морфологические генетические маркеры растений, Генетика. 2020;12(56):1366-1377. DOI: 10.31857/S0016675820120048.

3. Гашенко Т. А., Фролова Л. В., Божидай Т. Н. Изучение генетического разнообразия образцов малины с использованием SSR-маркеров, Плодоводство. 2023;35(2):54-61. DOI: 10.1234/0134-9759-2023-35-54-53.

4. Столповский Ю. А., Пискунов А. К., Свищева Г. Р. Геномная селекция. I. Последние тенденции и возможные пути развития, Генетика. 2020;56(9):1006-1017. DOI: 10.31857/S0016675820090143.

5. Камнев А. М., Антонова О. Ю., Дунаева С. Е. Молекулярные маркеры в исследованиях генетического разнообразия представителей рода Rubus L. и их перспективы в селекции, Вавиловский журнал генетики и селекции. 2020;24(1):20-30. DOI: 10.18699/VJ20.591.

6. Meng Q, Manghwar H, Hu W. Study on Supergenus Rubus L.: Edible, Medicinal, and Phylogenetic Characterization, Plants. 2022;11(9):1211. DOI: 10.3390/plants11091211.

7. Šiško M., Ivančič A., Šušek A. Determination of Raspberry Cultivar Authenticity Based on Multiplexed Microsatellite Fingerprinting, International Journal of Fruit Science. 2021;21(1):1018-1029. DOI: 10.1080/15538362.2021.1975011.

8. Фролова Л. В., Гашенко Т. А., Гашенко О. А. Современные направления селекции малины, Плодоводство. 2021;33:211-226. DOI: 10.47612/0134-9759-2021-33-211-226.

9. Draper J., Armitage F., Dury G., Jacob L., Walden R., Kumar A., Jeff erson R., Hamil D. Plant genetic transformation and gene expression. A laboratory manual. Oxford; Boston: Black-well Scientifi c Publications, 1988, 366 p.

10. Lebedev V. G., Subbotina N. M., Maluchenko O. P., Krutovsky K. V., Shestibratov K. A. Assessment of genetic diversity in diff erently colored raspberry cultivars using SSR markers located in flavonoid biosynthesis genes, Agronomy. 2019;9(9):518. DOI: 10.3390/agronomy9090518.

11. Castillo N.F.R., Reed B. M., Graham J., Fernandez-Fernandez F., Bassil N. V. Microsatellite markers for raspberry and blackberry. J Am Soc Hortic Sci. 2010;135(3):271-278. DOI: 10.21273/JASHS.135.3.271.

12. Fernandez-Fernandez F., Antanaviciute L., Govan C. L., Sargent D. J. Development of a multiplexed microsatellite set for fingerprinting red raspberry (Rubus idaeus) germ-plasm and its transferability to other Rubus species. J Berry Res. 2011;1:177-187.

13. Jaccard P. Distribution de la flore alpine dans le Bassin des Dranses et dans quelques regions voisines. Bull. Soc, Vaudoise sci. Natur. 1901;37:241-272.