ОЦЕНКА ЭФФЕКТИВНОСТИ КОММЕРЧЕСКИХ НАБОРОВ ДЛЯ ВЫДЕЛЕНИЯ ДНК ИЗ ЛАВАНДИНА (LAVANDULA × INTERMEDIA EMERIC EX LOISEL.)
Аннотация
В статье описаны результаты выделения геномной ДНК из листьев лавандина сорта Рабат с использованием готовых коммерческих наборов. Приведены данные концентрации ДНК и ее качества, полученные спектрофотометрическим анализом, методом электрофореза в агарозном геле и с использованием автоматизированной системы для электрофореза Agilent 4200 TapeStation. Сделаны выводы о предпочтительном применении набора NucleoSpin® Рlant II Midi kit для выделения ДНК из листьев лавандина.
Об авторах
И. В. Булавин
ФГБУН «НБС-ННЦ»
Россия
нс лаб. геномики растений и биоинформатики, к.б.н.
Россия
нс лаб. геномики растений и биоинформатики, к.б.н.
В. А. Браилко
ФГБУН «НБС-ННЦ»
Россия
зав. лаб. геномики растений и биоинформатики, к.б.н.
Россия
зав. лаб. геномики растений и биоинформатики, к.б.н.
О. А. Гребенникова
ФГБУН «НБС-ННЦ»
Россия
снс лаб. геномики растений и биоинформатики, к.б.н.
Россия
снс лаб. геномики растений и биоинформатики, к.б.н.
М. С. Андреев
ФГБУН «НБС-ННЦ»
Россия
мнс лаб. геномики растений и биоинформатики
Россия
мнс лаб. геномики растений и биоинформатики
О. В. Кривенко
ФГБУН «НБС-ННЦ»; ФИЦ ИнБЮМ
Россия
внс лаб. геномики растений и биоинформатики, к.б.н.
Россия
внс лаб. геномики растений и биоинформатики, к.б.н.
И. В. Митрофанова
ФГБУН «НБС-ННЦ»
Россия
зав. отделом биологии развития растений, биотехнологии и биобезопасности, д.б.н.
Россия
зав. отделом биологии развития растений, биотехнологии и биобезопасности, д.б.н.
Список литературы
1. Ghaffariyan S., Mohammadi S. A., Aharizad S. DNA isolation protocol for the medicinal plant lemon balm (Melissa officinalis, Lamiaceae) // Genet. Mol. Res., 2012. — V. 11. — P. 1049‒1057.
2. Vega-Vela N. E., Chacоn-Sanchez M. I. Isolation of high-quality DNA in 16 aromatic and medicinal Colombian species using silica-based extraction columns // Agronomía Colombiana, 2011. — V. 23. — № 3. — P. 349‒357.
3. Sharma P., Joshi N., Sharma A. Isolation of genomic DNA from medicinal plants without liquid nitrogen // Indian Journal of Experimental Biology, 2010. — V. 48. — № 6. — P. 610‒614.
4. Митрофанова И. В., Палий А. Е., Гребенникова О. А., Браилко В. А., ЛесниковаСедошенко Н. П., Работягов В. Д., Митрофанова О. В. Адаптационная способность перспективных сортов лаванды и лавандина при культивировании in vitro и ex situ // Сельскохозяйственная биология, 2018. — Т. 53. — Вып. 3. — С. 539‒546.
5. Паушева З. П. Практикум по цитологии растений. — М.: Колос, 1980. — 304 с.
6. Hammer О., Harper D. A. T., Ryan P. D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica, 2001. — V. 4. — № 1. — 9 p.
7. Работягов В. Д., Хохлов Ю. С., Палий А. Е. Морфобиологическая характеристика перспективных форм лавандина (L. × intermedia Emeric ex Loisel.) // Бюллетень ГНБС, 2017. — Вып. 123. — C. 83‒89.
8. Sambrook J., Russel D. Molecular cloning: a laboratory manual, vol. 1. — NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 3rd edition, 2001. — 2100 p.
9. Tan S. C., Yiap B. C. DNA, RNA, and protein extraction: the past and the present // Journal of Biomedicine and Biotechnology, 2009. — V. 2009. — Article ID 574398, 10 p.
10. Poms R. E., Glossl J., Foissy H. Icreased sensitivity for detection of specific target DNA in milk by concentration in milk fat // European Food Reseach and Technology, 2001. — V. 213. — Р. 361−365.
11. Остроумов Л. А., Просеков А. Ю., Архипов А. Н., Мудрикова О. В. Метод выделения растительной ДНК из растений и продуктов питания на их основе // Известия Самарского научного центра Российской академии наук, 2010. — Т. 12. — № 4(3). — С. 722−724.
12. Рябушкина Н. А., Омашева М. Е., Галиакпаров Н. Н. Специфика выделения ДНК из растительных объектов // Биотехнология. Теория и практика, 2012. — № 2. — С. 9−26.
13. Tiwari S., Tomar R. S., Tripathi M. K., Ahuja A. Modified Protocol for Plant Genomic DNA Isolation // Indian Res. J. Genet. & Biotech., 2017. — V. 9. — № 4. — P. 478−485.
При поддержке: Исследования выполнены на базе уникальной научной установки «Научный центр биотехнологии, геномики и депонирования растений» (УНУ «ФИТОБИОГЕН») в рамках госзадания № 0829-2019-0038 ФГБУН «НБС-ННЦ». Авторский коллектив благодарит куратора генофондовой коллекции лаванды, научного сотрудника лаборатории эфиромасличных растений ФГБУН «НБС-ННЦ» Ю. С. Хохлова за предоставленные для исследования растения, выращиваемые в открытом грунте, и младших научных сотрудников лаборатории биотехнологии и вирусологии растений С. В. Челомбит и И. В. Жданову за предоставленные для исследований микропобеги лавандина in vitro.
Для цитирования:
Булавин И.В., Браилко В.А., Гребенникова О.А., Андреев М.С., Кривенко О.В., Митрофанова И.В. ОЦЕНКА ЭФФЕКТИВНОСТИ КОММЕРЧЕСКИХ НАБОРОВ ДЛЯ ВЫДЕЛЕНИЯ ДНК ИЗ ЛАВАНДИНА (LAVANDULA × INTERMEDIA EMERIC EX LOISEL.). Плодоводство и ягодоводство России. 2019;59:286-293. https://doi.org/10.31676/2073-4948-2019-59-286-293
For citation:
Bulavin I.V., Brailko V.A., Grebennikova O.A., Andreev M.S., Krivenko O.V., Mitrofanova I.V. EFFICIENCY EVALUATION OF COMMERCIAL KITS FOR DNA ISOLATION FROM LAVANDINE (LAVANDULA × INTERMEDIA EMERIC EX LOISEL.). Pomiculture and small fruits culture in Russia. 2019;59:286-293. (In Russ.) https://doi.org/10.31676/2073-4948-2019-59-286-293
Просмотров: 161
Послать статью по эл. почте 